Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms