Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms