Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms