Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms