Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms