Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms