Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms