Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms