Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms