Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms