Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms