Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms