Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB6BQ9NRW1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms