Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYLDQ9NQC7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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