Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms