Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB18Q9NP72 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB18Q9NP72 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms