Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms