Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00597Q9H2U6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms