Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZYG11BQ9C0D3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms