Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV8

CEP41, Centrosomal protein of 41 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP41Q9BYV8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP41Q9BYV8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms