Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms