Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TDRD1Q9BXT4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms