Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms