Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TINF2Q9BSI4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TINF2Q9BSI4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms