Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms