Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms