Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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TRIM63Q969Q1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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