Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms