Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms