Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDAQ92838 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDAQ92838 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDAQ92838 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDAQ92838 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDAQ92838 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDAQ92838 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDAQ92838 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDAQ92838 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDAQ92838 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDAQ92838 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDAQ92838 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDAQ92838 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms