Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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RABGGTAQ92696 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RABGGTAQ92696 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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RABGGTAQ92696 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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RABGGTAQ92696 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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RABGGTAQ92696 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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RABGGTAQ92696 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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