Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD3

RNF138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF138Q8WVD3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF138Q8WVD3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms