Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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ZNF548Q8NEK5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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ZNF548Q8NEK5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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