Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF1Q8N6C5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms