Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C9

C17orf78, Uncharacterized protein C17orf78, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf78Q8N4C9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf78Q8N4C9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms