Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC51AQ86UW1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC51AQ86UW1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC51AQ86UW1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC51AQ86UW1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC51AQ86UW1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms