Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC73Q6ZRK6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms