Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms