Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms