Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms