Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUPD1Q68J44 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms