Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms