Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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