Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYOM3Q5VTT5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOM3Q5VTT5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms