Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOGA3Q5TF21 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOGA3Q5TF21 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms