Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms