Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHSL1Q5SYE7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms