Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITRM1Q5JRX3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms