Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms