Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms